中央空调的水系统分为冷却水和冷冻水系统，其中冷却水系统主要靠冷却塔散热。水在冷却塔中滴溅成无数小水珠或在填料表面成膜状流动，充分与空气接触，把空气中大量灰尘、微生物、可溶性盐类及腐蚀性气体带入冷却水中，使水中杂质浓度不断增加；此外由于水不断蒸发、泄漏、飞散，也使水的杂质浓度提高，这将给中央空调系统的运行带来很多危害。冷冻水方面则由于腐蚀性大，极易造成盘管堵塞，机组及管路附件腐蚀，影响系统正常运行。